中國‧3天破基因‧3天尋快速診斷法‧深圳華大基因研究院‧解腸毒疫情主力成員


  • 迅速破解新型腸出血性大腸桿菌基因密碼的深圳華大基因研究院,全院有4000人員,有多達180部基因排序機,DNA排序能力是全球之冠。(圖:香港明報)

(中國)新型腸出血性大腸桿菌(EHEC)在歐美各國先後爆發,在歐洲最少已造成19人死亡。這次迅速破解EHEC基因之謎的,深圳的華大基因研究院。研究院人員6月3日接受本報專訪時表示,他們只花了3天時間便初步完成這款新型大腸桿菌的基因排序,發現該菌至少對3種主要抗生素類型有抗藥性,毒性亦非常強。研究員希望在3天後研發出針對的治療措施,有效控制疫情蔓延。

民營的深圳華大基因研究院曾在2003年SARS期間,成功以一星期時間迅速排列出SARS病毒基因排序,幫助開發出病毒疫苗。這次歐美12國爆發腸出血性大腸桿菌疫情,研究院再成為破譯及幫助應對這次疫情的主要成員。

分析成果上載
國際共用

“華大基因”市場部總監楊碧澄博士透露,德國疫情爆發後,德方專家求助華大基因在歐洲的研究員,研究院在5月23日從德國漢堡大學醫學院得到大腸桿菌樣品,花了3天時間即初步完成了基因組測序和分析,此院更把成果上載到公共數據庫,讓各國研究員和機構共享成果。

病菌結構複雜
合用藥物少

她透露,華大基因這次迅速成立專組,利用先進的第3代測序儀,對病菌進行測序和生物信息學分析,“團隊發現該菌株是一種新型,兼具侵襲、產毒、腸出血等特徵的大腸桿菌”。她說,此病菌結構奇怪複雜,有多種致病基因融合一起,“很多基因似乎是來自大腸桿菌,因而具有導致腸出血的能力”,治療亦比較困難。研究又發現,該菌株攜有氨基糖類、大環內酯類、磺胺類等抗生素的抗藥基因,由於這些抗生素都是常用於治療腸胃感染的第一線藥物,導致合用的治療藥物種類更少。

正測試快速診斷試劑

世衛專家3日亦表示,導致這次疫潮的大腸桿菌很罕見,過去雖然曾有在人類身上發現的個案,但從未試過爆發。楊碧澄說,目前仍未知此大腸桿菌的來源,不能排除此菌曾長期存在,只是不為人知。他們經過對比基因圖庫,發現這種大腸桿菌與2002年從非洲中部愛滋病患者腹瀉樣本中分離的腸侵襲性大腸桿菌株有96%相似,是與另一種大腸桿菌出現基因變異變成的新品種。

此院會繼續研究,通過對基因序列瞭解此病菌的特性,期望3天後可以找出針對診斷、監測等方案。“我們在研發快速診斷試劑,現正作測試,希望用來測出食物和病人體內是否有這種病菌。”

“研究院的合作伙伴可以通過此成果,應用到臨上,研製出有效的藥物和採取預防措施。希望愈快愈好。”(香港明報)